21世紀，地球回復昔日的和平，但此時宇宙墜下一顆隕石，隕石有一個人工的時空囊。地球和平聯盟TPC的GUTS小隊通過時空囊了解到地球將有大災難發生。而此時，時空囊預言的兩大怪獸·“哥路渣”和“米路巴”先后出現，GUTS小隊便根據預言尋找收藏在金字塔的三大巨人的身體。...

超古代的地球曾經擁有相當高度的文明，但宇宙聯盟奧可夫·馬納夫擔心人類文明會破壞宇宙的和平，所以出動大軍將人類文明徹底消滅。...

450年前，企圖稱霸宇宙的哈迪斯大帝戰敗而被幻神星人娜倫用史特拉石碑陣封印。 450年后的現代，為了復活哈迪斯，其手下佐拉博士派遣機動騎士與宇宙巨獸攻擊地球。幸運的是，在此同時，幻星神獸雷零守亦因此蘇醒，而原來平凡的高中生伊達翔太、真田由加以及就讀京南大學的平賀真也，受到召喚化身成為幻星神戰士，負責保護地球這一神圣使命。...